​Tần suất lũ lớn có xu hướng rút ngắn lại từ 8 - 10 năm 1 lần trước đây, nay xuống còn 3 - 4 năm 1 lần (1961, 1966, 1978, 1984, 1991) và liên tiếp trong 3 năm lũ lớn liên tục xảy ra (1994, 1995, 1996) và đặc biệt là năm 2000 lũ rất lớn. 
     - Mức ngập nước theo diện tích tự nhiên năm 1996 như sau :
      + Dưới 50 cm với diện tích ngập 50.294 ha, chiếm 13,2 % diện tích tự nhiên(DTTN).
      + Từ 50 - 100 cm với diện tích ngập 72.360 ha, chiếm 18,99% DTTN.
      + Từ 100 -150 cm với diện tích ngập 63.830 ha, chiếm 16,75% DTTN.
      + Từ 150 - 200 cm với diện tích ngập 94.840 ha, chiếm 24,88% DTTN.
      + Từ 200 - 250 cm với diện tích ngập 66.720 ha, chiếm 17,50% DTTN.
      + Ngập trên 250 cm với diện tích ngập 33.070 ha, chiếm 8,68% DTTN.
   - Thời gian ngập lũ :
      + Dưới 3 tháng 305.757 ha, chiếm 69,91% diện tích tự nhiên.
      + Từ 3 - 5 tháng 64.724 ha, chiếm 30,09 % diện tích tự nhiên.
    Đặc biệt là trong năm 2000 lũ lớn nhất trong nhiều thập niên qua và thời gian ngâm lũ kéo dài gây thiệt hại rất lớn đến sản xuất và đời sống dân cư. Mực nước cao nhất xuất hiện tại Mộc Hóa (Long An) là 3,27 mét, cao hơn 41 cm so với đỉnh lũ 1978. lũ đổ mạnh về phía Nam cộng hưởng với đợt triều cường gây ngập sâu và trên diện rộng gần 300.000 ha tự nhiên, bao gồm 132/188 xã phường, tương ứng 12/14 huyện thị của tỉnh. Độ ngập bình quân từ 1,5 - 2 mét, có vùng ngập sâu trên 3 mét. Tổng thiệt hại về vật chất gần 650 tỷ đồng. 
    Hiện nay tỉnh đang phối hợp với các dự án kiểm soát lũ của Trung ương để xây dựng hệ thống cống đập nhằm kiểm soát lũ một cách chặt chẽ và hữu hiệu hơn, lũ nhỏ cố gắng giữ nước, lũ lớn cho rữa trôi phèn, cải tạo đất. Đầu tư xây dựng 186 cụm, tuyến dân cư nhằm đảm bảo cho người dân chung sống vững chắc và ổn định trong mùa lũ. Trong đầu tư xây dựng chọn cao trình vượt mức ngập lũ năm 2000.